Analyse von größeren Datensätzen

English version

Geben Sie die Datei mit den zu analysierenden Daten samt zugehörigem Datenformat ein, wählen Sie die gewünschte Bandenauflösung, einen Map-Viewer, mit welchem die Chromosomenbanden verknüpft werden, und die maximale Anzahl von zu analysierenden Fällen. Die Reihenfolge der Chromosomen, die Skalierung und der Cut-Off für strukturelle und numerische Aberrationen (d.h. der Wert, der als Maximalwert gezeichnet wird) können für die Grafiken eingestellt werden.

Mögliche Datenformate sind das Format der Mitelman-Datenbank, oder ein sehr einfaches Sonderformat, das nur die Fall-Identifikation und den Karyotyp beinhaltet, die voneinander mit einem Tabulator oder einem anderen Trennzeichen getrennt sind, mit einem Fall pro Zeile; dieses Format ist auch an die CGH angepaßt worden. Zusätzliche Information erhalten Sie im "HowTo zu Datenformaten."

Wenn Sie nicht damit vertraut sind, wie Sie Daten aus der Mitelman-Datenbank erhalten können, lesen Sie bitte die kurze Beschreibung "Retrieving data from the Mitelman database" (nur in englischer Sprache). Beachten Sie bitte auch, daß manche Daten in der Mitelman-Datenbank eine ältere Version der ISCN als die ISCN 1995 verwenden. Solche Daten können noch kompatibel mit der ISCN 1995 sein und werden somit korrekt analysiert, aber manche Daten könnten bereits inkompatibel sein und daher fehlerhaft ausgewertet werden; weitere Informationen zu ISCN Fehlern erhalten Sie im HowTo-Dokument "ISCN-Fehler-Analyse".

Parameter

Datei:

Format:

 Mitelman    Sonderformat (Bänderungs-Analyse)   Sonderformat (CGH)

Nur für die Sonderformate:

Trennzeichen:  Tabulator   Pipe ("|")   Leerstelle (" ")

Kopfzeile ist vorhanden

Verknüpfung mit MapViewer

NCBI Ensembl

Banden-Auflösung:

2 Ziffern   400 Banden   550 Banden

Anzahl der Fälle:

Die maximale Anzahl von analysierbaren Fällen ist aus technischen Gründen (Dauer der Berechnung) auf den unten angegebenen Wert begrenzt. Sie können auch einen noch geringeren Wert wählen.

Maximalzahl der Fälle:
Alle analysierten Fälle:
Gültige Fälle:

Andere Zeichnungs-Parameter:

Wenn kein CutOff gewünscht wird, geben Sie "0" ein.

CutOff Bruchpunkte
CutOff Gewinne/Verluste
Skalierung

Die Reihenfolge der Chromosomen in den Grafiken ist unten angegeben. Die Chromosomen-Nummern werden mit Kommas getrennt, "BR" steht für einen Zeilenumbruch.

Drawing Sequence: