Online-Karyogramm-Erstellung

English version

Die Software erstellt ein Bild mit den Chromosomen (sowohl normale als auch veränderte) einer ISCN-Formel.

Geben Sie in unten stehendes Textfeld eine ISCN-Formel ein, wählen Sie einen MapViewer, mit welchem die Chromosomenbanden zu verknüpfen sind, sowie die gewünschte Bandenauflösung, die farbliche Darstellung und die Reihenfolge der Chromosomen, und klicken dann auf "Zeichnen". Die CyDAS Software berechnet daraufhin ein interaktives Bild, das die Ideogramme aller derivativen und nicht-derivativen Chromosomen des Karyotyps (= "Karyogramm") darstellt, mit Verknüpfungen zum NCBI oder Ensembl MapViewer.

Es ist absolut unverzichtbar, daß Bruchpunkte angegeben werden; erfolgt die Angabe der Bruchpunkte mit einer geringeren Auflösung als die Zeichnung, können Ungereimtheiten entstehen. Ring-Chromosomen werden linearisiert dargestellt; Marker-Chromosomen (linear oder ringförmig) werden nicht gezeichnet. Kleinere Fehler in der ISCN-Formel werden automatisch korrigiert.

Hinweise zu bekannten Problemen sowie zur Technik der Karyogramm-Berechnung gibt es in der Dokumentation.

Eine experimentelle Seite für die Schritt für Schritt-Entwicklung eines Karyogramms ist auch vorhanden.

Verknüpfung zum MapViewer: NCBI Ensembl

Auflösung:2 Ziffern   400 Banden    550 Banden   800 Banden

Skalierung:

Die Reihenfolge der Chromosomen in den Grafiken ist unten angegeben. Die Chromosomen-Nummern werden mit Kommas getrennt, "BR" steht für einen Zeilenumbruch.

Drawing Sequence:

 

Zitierung der CyDAS-Software

Um die Benutzung der CyDAS-Software von dieser Website in eine Veröffentlichung zu zitieren, machen Sie bitte folgende Angaben:
Hiller B, Bradtke J, Balz H and Rieder H (2004): "CyDAS Online Analysis Site", http://www.cydas.org/OnlineAnalysis/"

Um die Benutzung eines Programms des CyDAS-Software-Packetes (ein Programm des Software-Packetes selbst oder Ihr eigenes Programm, welches ein Programm des Packetes verlinkt) in einer Veröffentlichung zu zitieren, machen Sie bitte folgende Angaben:
Hiller B, Bradtke J, Balz H and Rieder H (2004):
"CyDAS: a cytogenetic data analysis system",
BioInformatics 2005 21(7):1282-1283; doi:10.1093/bioinformatics/bti146.
Bioinformatics Advance Access originally published online on November 16, 2004 [Abstract] [PDF] [HTML-Text]

Kommentare und Anfragen schicken Sie bitte an: info@cydas.org.